自动化学院原名自动化系成立于1989年，是我院最早成立的骨干系部之一，也是我院最具有鲜明特色的教学系部之一。现任总院院长朱忠才教授担任自动化系第一届系主任，最初建系地址租赁于北京科技大学校园内，办校首年只面向北京市招生，当时在校学生为48人，后来随着学校规模的不断扩大，在校生人数不断增加，来源地遍及全国各地，自动化系于1997年在海淀区北沙滩双泉堡租赁土地30余亩,并筹建了完全属于自动化系自己的教学楼、学生宿舍及生活区，从此自动化系有了真正属于自己的根据地，1999年在校人数已发展到一千余人，专业设置也不断增加，文凭考试取证率每班均在75%以上，就业率高达95%以上，成为真正意义上的全院实力最强、人数最多的系，并被国家教育部远程教育中心列为定点培训学校之一。2000年自动化系抽调自身的一部分骨干力量组建了计算机科学与技术系、软件工程系等系部。中国管理软件学院至此开始逐成规模，成为全北京市比较有影响力的民办高校之一。2007年以自动化系为主，联合IT研究院、宏志班等系部成立了自动化学院，规模进一步扩大，仍属全院最具实力系部之一。

    自动化学院始终坚持以开设社会热门专业为先导，并以严格的管理为著称，一切以服务教学为中心的办学理念。
    自动化学院现开设有计算机控制及应用、计算机网络、自动化软件应用、网络游戏开发、网页设计与数据开发等五大专业。专业设置以就业为导向，人才培养以职业技能和职业素质为指引，其中计算机控制及应用专业为我院重点建设专业。自动化学院一向以计算机控制及应用专业而闻名，所开专业应用范围广，特别是“信息高速公路”的全面推广，从而使计算机网络专业显得尤为重要，计算机在未来的社会中将起着重要的作用。所有这些专业，都是发展中的先进尖端科学技术自成立以来，一直坚持用高标准自我定位，引入一流的管理理念、管理体制和管理方法，要求教师按多元的教育质量观、用创新灵活的教育教学体系来保护和发展学生的差异和个性，引进新思想、新观念、新技术、新方法，让学生放飞青春，激活思想。自动化学院始终把德育工作作为学生管理工作的重点，相信学生，重启发；尊重学生，重引导；爱护学生，重理解，已初步形成了一个良好的系风、教风和学风。培养的学生基础理论扎实，动手能力强，并具有一定的科研能力，得到社会的一致好评。我院为造就和培养一批新型的人才创造着更严谨、更完美、更优秀的教学方法。

    国家承认学历取证率全校最高，文凭考试为70%以上，国考所获北京大学本科毕业证书为全校之最，其中多人获学士学位称号。

    2002年7月，北京市高等教育学历文凭考试中自动化系12人获《高等数学》满分100分。
    2003年10月—2005年1月的历届文考(国考)中，专业课课程考试获满分100分者近二十余人，《北京考试报》在2005年3月5日第八版进行专门报道。
    2000年被教育部信息管理中心批准为远程教育长期培训点。
    2008年北京市高等教育自学考试考试061班韩海英获《高等数学工本》满分，誉为京城自考状元。
    全院举行的共八届“中软杯”专业知识竞赛中，自动化系荣获团体总分八连冠。
    全院举行的共八届田径运动会中，自动化系荣获5届冠军、3届亚军。
    自动化系毕业生实践动手能力强，得到京城众多中小IT业公司认可，薪水较高，已有部分优秀毕业生在北京购买房地产，出国工作及深造人数也是全院最多。(详见优秀毕业生介绍版块)